扫描电镜和透射电镜是两种常用的电子显微镜，它们在工作原理、成像模式、样品制备和应用领域等方面存在一些不同。

工作原理：扫描电镜通过聚焦电子束扫描样品表面，从而获得样品表面的形貌信息。透射电镜则通过聚焦电子束穿过样品薄片，获得样品内部结构的信息。

成像模式：扫描电镜成像模式包括二次电子成像和反射电子成像，能够获得样品表面形貌、组成和结构信息。透射电镜成像模式包括透射成像和衍射成像，能够获得样品内部结构的信息。

样品制备：扫描电镜的样品制备通常是将样品表面进行金属镀膜或者碳膜处理，以增加样品导电性；透射电镜的样品制备需要将样品切成非常薄的薄片，通常在纳米或亚纳米级别。

应用领域：扫描电镜主要应用于材料学、生物学、地质学等领域，例如纳米材料形貌、微观结构、表面形貌、病毒等。透射电镜则主要应用于材料学、化学、生物学等领域，例如金属晶体结构、电子衍射、细胞超微结构等。

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